Der Kopf des Baumkrokodils ist recht leicht gebaut. Die Schnauze ist stumpf, die Nasenlöcher sind nahe an der Schnauze und eher rund als schlitzförmig. Die Zähne sind seitlich abgeflacht, leichtgebogen und sehr scharf, aber nur schwach gesägt. Sie stehen nahezu aufrecht auf den Kieferknochen und sind sehr lang. Die Grundfarbe reicht von braun bis tiefschwarz, daneben zeigt die Art unregelmäßig verteilte gelbe Punkte und Augenflecke sowie Querringe um den Schwanz. Das Baumkrokodil erreicht eine Gesamtlänge von über 2,50 m. Das längste zuverlässig gemessene Exemplar war insgesamt 2,65 m lang. Baumkrokodile fressen Insekten, kleine Säuger, Vögel und deren Eier.
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In Neuguinea halten die Eingeborenen das Baumkrokodil für einen bösen Geist, der Bäume erklettert, aufrecht läuft, Feuer spuckt und Menschen tötet. Laut Aussagen der Einheimischen soll er auch Menschen töten und essen, ein Beweis hierfür gibt es aber nicht.
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